La cueva se formó hace 60 millones de años, en el periodo conocido como Cretácico Inferior. Su descubrimiento ocurrió cuando los musulmanes, que ocupaban el territorio durante la Edad Media, encontraron una gran corriente de agua y pretendieron llevarla hasta sus huertos. Muchos perecieron en el intento encontrándose restos óseos de aquellos hombres en el interior de la cueva. Algunas leyendas dicen que los huesos encontrados formaban  parte de una expedición de moriscos, que huían del Cid.

Fue habitada por osos, hienas, toros, caballos, rinocerontes y hasta hipopótamos, cuyos esqueletos se encuentran  en el Museo Arqueológico de Alcoy.  En las paredes de la  cueva hay fósiles de organismos prehistóricos, a la vista de los visitantes, como embalsamados y expuestos.